Genomics of Olea europaea cultivars

The files in this collection are supplemental information for the research article "Genomics of Olea europaea cultivars and the questionable nature of PCR marker counts", Richard B. Frost, 2023. Further inquiries can be directed to https://frostconcepts.org/. CONTENT SIZES Ax~=b.zip 8.7 GB Farga FNA Chromosome Data.zip 141.2 MB Farga MX Chromosome Data.zip 275.5 MB Farga TXT Chromosome Data.zip 275.4 MB Koehmstedt Data.zip 483.8 KB Mathematica.zip 429.5 MB Merged Data.zip 19.7 KB Primer Correlations.zip 12.2 GB Primer Displacements.zip 17.2 KB Primer Forms.zip 126.4 MB Primer Locations.zip 1.3 GB Primer Properties.zip 8.6 GB Profile Data.zip 90 KB Profile Distances.zip 369.1 KB Raw Accession Data.zip 1.7 MB README.txt 3.2 KB SSR Motifs.zip 7.1 GB ----------------------------- -------- Total 39.1 GB CONTENT FILE TYPES .zip zipped folders created by 7-Zip File Manager .gz GNU compressed files, can be uncompressed by 7-Zip .csv comma separated values file of tabular data .fna FASTA format chromosome sequence .pdf Adobe PDF .tsv tab separated values file of tabular data .txt ASCII text .xlsx MS Excel worksheet .m auto-generated Mathematica package file .mx can only be read by Mathematica v.12 or greater on Intel i9 platform .nb Mathematica notebook files requiring v.12 or greater Note 1: several tabular files are too large for input to standard spreadsheet programs. Note 2: nearly all .mx files have been converted to .tsv files for generic distribution. Note 3: tabular data files can contain cells with multi-dimension data, delimited by "{", ",", and "}" characters. Further parsing of these files will be necessary to use them in 3rd party software. Note 4: the directory organization for this software is specified in "0000 Olive package". Note 5: origin of a specific file can usually be found with program "0100 Notebook Text Finder". Note 6: novice users of Mathematica should not attempt to modify .nb files. CONTENT ASSOCIATIONS Folder Article section(s) ----------------------------- ----------- Koehmstedt Data.zip 1 Raw Accession Data.zip 4.2.a Profile Data.zip 4.2.b Merged Data.zip 4.2.c Profile Distances.zip 4.3 Farga FNA Chromosome Data.zip 4.5 Farga MX Chromosome Data.zip 4.5 Farga TXT Chromosome Data.zip 4.5 SSR Motifs.zip 4.6 Primer Properties.zip 4.7 Primer Correlations.zip 4.8.1 Primer Locations.zip 4.8.1 Primer Forms.zip 4.8.2.a Ax~=b.zip 4.8.2.c Primer Displacements.zip n/a Mathematica.zip source code本合集内的所有文件均为研究论文《油橄榄（Olea europaea）栽培品种基因组学与PCR标记计数的可疑性质》（作者Richard B. Frost，2023年）的补充资料。如需进一步咨询，可联系https://frostconcepts.org/。 ### 文件大小 Ax~=b.zip：8.7 GB Farga FNA 染色体数据.zip：141.2 MB Farga MX 染色体数据.zip：275.5 MB Farga TXT 染色体数据.zip：275.4 MB Koehmstedt 数据.zip：483.8 KB Mathematica.zip：429.5 MB 合并数据.zip：19.7 KB 引物相关性数据.zip：12.2 GB 引物位移数据.zip：17.2 KB 引物形式数据.zip：126.4 MB 引物定位数据.zip：1.3 GB 引物属性数据.zip：8.6 GB 谱型数据.zip：90 KB 谱型距离数据.zip：369.1 KB 原始种质数据.zip：1.7 MB README.txt：3.2 KB SSR 基序数据.zip：7.1 GB 总计：39.1 GB ### 文件类型说明 .zip：由7-Zip文件管理器创建的压缩文件夹 .gz：GNU压缩文件，可通过7-Zip解压 .csv：逗号分隔值格式的表格数据文件 .fna：FASTA格式染色体序列文件 .pdf：Adobe可移植文档格式文件 .tsv：制表符分隔值格式的表格数据文件 .txt：ASCII文本文件 .xlsx：Microsoft Excel工作表文件 .m：自动生成的Mathematica包文件 .mx：仅可在Intel i9平台且Mathematica v12及以上版本中读取的文件 .nb：需Mathematica v12及以上版本运行的Mathematica笔记本文件 ### 注意事项 注1：部分表格文件体积过大，无法在标准电子表格软件中直接导入。 注2：绝大多数.mx文件已转换为.tsv文件，以支持通用分发。 注3：表格数据文件可能包含以"{", ",", "}"字符分隔的多维数据单元格，需进一步解析后方可在第三方软件中使用。 注4：本数据集的目录组织结构详见"0000 Olive package"。 注5：特定文件的来源通常可通过程序"0100 Notebook Text Finder"查询。 注6：Mathematica新手用户请勿尝试修改.nb格式文件。 ### 文件与论文章节关联 Koehmstedt 数据.zip：第1节 原始种质数据.zip：第4.2.a节 谱型数据.zip：第4.2.b节 合并数据.zip：第4.2.c节 谱型距离数据.zip：第4.3节 Farga FNA 染色体数据.zip：第4.5节 Farga MX 染色体数据.zip：第4.5节 Farga TXT 染色体数据.zip：第4.5节 SSR 基序数据.zip：第4.6节 引物属性数据.zip：第4.7节 引物相关性数据.zip：第4.8.1节 引物定位数据.zip：第4.8.1节 引物形式数据.zip：第4.8.2.a节 Ax~=b.zip：第4.8.2.c节 引物位移数据.zip：无对应章节 Mathematica.zip：源代码