PlantPAN

PlantPAN 4.0 is an integrative resource for constructing transcriptional regulatory networks for diverse plant species. In this release, the gene annotation and promoter sequences were expanded to cover 115 species. PlantPAN 4.0 can help users characterize the evolutionary differences and similarities among cis-regulatory elements; furthermore, this system can now help in identification of conserved non-coding sequences among homologous genes.

PlantPAN 4.0是一款面向多种植物物种、用于构建转录调控网络的整合型资源库。在本次版本更新中，其基因注释与启动子序列的覆盖范围已扩展至115个物种。PlantPAN 4.0可助力用户解析顺式调控元件（cis-regulatory elements）间的进化异同；此外，该系统现已可用于鉴定同源基因（homologous genes）间的保守非编码序列（conserved non-coding sequences）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PlantPAN 4.0是一个植物启动子分析数据库，专注于检测转录因子结合位点、转录因子和其他调控元件，以研究植物基因转录调控。它包含3428个非冗余的植物转录因子矩阵和115个植物物种的启动子序列，支持多种分析功能，如基因搜索、启动子分析和跨物种比较，帮助用户构建基因调控网络和识别保守非编码序列。