高温胁迫下烟粉虱共生菌及功能基因多维科研数据库

本数据集整合烟粉虱MED隐种在常温对照及梯度高温胁迫（37–43℃）下的16S rRNA测序、qRT-PCR及RNA-seq数据，涵盖Portiera、Hamiltonella、Rickettsia等共生菌丰度与热激基因（Hsp70/Hsp90/Hsf）表达谱。处理流程如下：
数据清洗：剔除关键字段（样本ID、处理温度、Ct值、Reads数）缺失记录；过滤测序质量低（Q30＜80%、比对率＜70%）样本；删除qPCR三重复CV＞15%或基因表达量为负的异常值，保留生物学重复≥3的样本。
标准化与注释：16S OTU按SILVA数据库注释并换算为相对丰度；qPCR数据以内参基因（β-actin）归一化，计算2^(-ΔΔCt)得相对表达量；RNA-seq原始Count转换为TPM并做log2(x+1)变换，校正批次效应；高温强度、共生菌感染状态按受控词表编码。
多维关联构建：将虫体基础信息、高温处理参数、共生菌丰度矩阵及基因表达矩阵按样本ID关联，计算共生菌丰度与热激基因表达的Spearman相关系数，标注多维特征标签，整理为结构化宽表，对采样地及实验人员信息做不可逆去标识化处理。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

本数据库整合了烟粉虱MED隐种在常温对照及梯度高温胁迫（37–43℃）下的16S rRNA测序、qRT-PCR及RNA-seq数据，涵盖Portiera、Hamiltonella、Rickettsia等共生菌丰度与热激基因（Hsp70/Hsp90/Hsf）表达谱。数据经清洗、标准化及多维关联构建后，以结构化宽表形式呈现，支持烟粉虱-共生菌-高温胁迫互作机制研究及农业害虫绿色防控等应用场景。