pdbbind-v2020

NIAID Data Ecosystem2026-03-14 收录

蛋白质-配体结合亲和力预测

药物虚拟筛选

数据链接：

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官方服务：

资源简介：

PDBbind-v2020 dataset reprocessed with Protein Preparation Wizard module in Schrodinger

创建时间：

2022-09-10

DUD-E Diverse

药物虚拟筛选

化合物分类

该数据集是一个包含102个靶标和大约150万个化合物的全面配体数据集，旨在为虚拟筛选方法提供一个平衡的基准数据集。其中，“Diverse”子集包含了来自8个靶标和8个诱饵集的116,105个化合物，每个靶标对应使用一个诱饵集，并根据蛋白质类型将这些化合物分为7类。该数据集的规模属于大型，所涉及的任务是虚拟筛选。

arXiv440

Dataset supporting MOLSMARTS: Benchmarking of a virtual Pharmacophore-based SMARTS Reaction Chemical Library

虚拟化学库生成与基准测试

药物虚拟筛选

1. Research introduction A pharmacophore-based SMARTS reaction-driven virtual chemical library (MOLSMARTS and atom base library generation (MOLHYBRID), which both can generate chemically valid, synthe

Mendeley Data50

Experimental results on the PDBbind core set.

蛋白质-配体结合亲和力预测

药物发现计算模型

Protein-ligand interactions are crucial in drug discovery. Accurately predicting protein-ligand binding affinity is essential for screening potential drugs. Graph neural networks have proven highly ef

Figshare2025-04-08 更新40

binding_affinity

蛋白质-配体结合亲和力预测

药物发现

jglaser/binding_affinity 仓库提供蛋白质序列和配体SMILES的结合亲和力数据，共包含190万个独特的配对，适用于微调语言模型。数据来源于BindingDB、PDBbind-cn、BioLIP和BindingMOAD。该仓库提供预处理后的数据集，并支持用户手动进行预处理。用户可以加载预先分割的训练集和验证集，或者选择移除特定蛋白质序列的数据集。

OpenCSG2024-07-19 更新170

List of compounds and weighted score for molecular docking.

分子对接

药物虚拟筛选

List of compounds and weighted score for molecular docking.

NIAID Data Ecosystem40