Wanda

we introduce a curated database named Wanda that lists groups of orthologous genes with one copy from man, mouse and chicken, one or two from tetraploid Xenopus and two or more ancient copies (i.e. paralogs) from ray-finned fish. The database also contains the sequence alignments and phylogenetic trees that were necessary for determining the correct orthologous and paralogous relationships among genes.本研究介绍了一个经人工整理的数据库Wanda，该数据库收录了一系列直系同源基因（orthologous genes）组：其中人类、小鼠与鸡各含1个基因拷贝，四倍体爪蟾（tetraploid Xenopus）含1或2个拷贝，辐鳍鱼（ray-finned fish）则拥有2个及以上的古老拷贝，即旁系同源基因（paralogs）。此外，该数据库还包含了用于明确基因间正确的直系同源与旁系同源关系所需的序列比对（sequence alignments）与系统发育树（phylogenetic trees）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Wanda 是一个经过人工整理的数据库，专门收录了来自人类、小鼠、鸡、四倍体非洲爪蟾以及辐鳍鱼等物种的同源基因群组。该数据库还提供了用于确定这些基因间正确同源和旁系同源关系的序列比对与系统发育树数据。