PTMsigDB
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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PTMsigDB, a database of modification site-specific signatures of perturbations, kinase activities and signaling pathways curated from more than 2,500 publications. We adapted the widely used single sample Gene Set Enrichment Analysis approach to utilize PTMsigDB, enabling PTM Signature Enrichment Analysis (PTM-SEA) of quantitative MS data.
PTMsigDB是一款经逾2500篇已发表文献人工整理收录的数据库，涵盖扰动、激酶活性与信号通路的修饰位点特异性特征签名。本研究团队将应用广泛的单样本基因集富集分析（single sample Gene Set Enrichment Analysis）方法适配至PTMsigDB数据库，从而可实现针对定量质谱（mass spectrometry, MS）数据的PTM特征富集分析（PTM Signature Enrichment Analysis，简称PTM-SEA）。
提供机构：
布罗德研究所搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
PTMsigDB是一个修饰位点特异性签名数据库，从超过2500篇文献中整理而来，涵盖扰动、激酶活性和信号通路等类别。它基于PhosphoSitePlus（PSP）构建，支持PTM-Signature Enrichment Analysis（PTM-SEA），用于定量质谱数据的分析。
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