1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3d (deuterated analog of inhibitor 3c)

1.65 A resolution structure of SARS-CoV-2 3CL protease in complex with inhibitor 3d (deuterated analog of inhibitor 3c) Descriptor: (1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid, (1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-bicyclo[3.3.1]non-6-en-3-yl)methoxy)carbonyl)amino)-4-methylpentanamido)-1-hydroxy-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propane-1-sulfonic acid, 3C-like proteinase, ... Authors: Lovell, S, Kashipathy, M.M, Battaile, K.P, Chamandi, S.D, Rathnayake, A.D, Nguyen, H.N, Baird, M.A, Kim, Y, Shadipeni, N, Chang, K.O, Groutas, W.C. Deposit date: 2021-02-02 Release date: 2021-02-17 Last modified: 2024-10-16 Method: X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) Cite: Structure-Guided Design of Conformationally Constrained Cyclohexane Inhibitors of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 3CL Protease. J.Med.Chem., 64, 2021

1.65埃分辨率的严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）3CL蛋白酶与抑制剂3d（抑制剂3c的氘代类似物）的复合物晶体结构。描述符：(1R,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-双环[3.3.1]壬-6-烯-3-基)甲氧基)羰基)氨基)-4-甲基戊酰胺基)-1-羟基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙烷-1-磺酸、(1S,2S)-2-((S)-2-(((((1R,3S,5S)-双环[3.3.1]壬-6-烯-3-基)甲氧基)羰基)氨基)-4-甲基戊酰胺基)-1-羟基-3-((S)-2-氧代吡咯烷-3-基)丙烷-1-磺酸、3C样蛋白酶（3C-like proteinase）…… 作者：Lovell S、Kashipathy M.M、Battaile K.P、Chamandi S.D、Rathnayake A.D、Nguyen H.N、Baird M.A、Kim Y、Shadipeni N、Chang K.O、Groutas W.C。提交日期：2021年2月2日；发布日期：2021年2月17日；最后修改日期：2024年10月16日。测试方法：X射线衍射（分辨率1.7埃）。引用文献：《严重急性呼吸综合征冠状病毒2型3CL蛋白酶的构象受限环己烷抑制剂的结构导向设计》，《药物化学杂志（J. Med. Chem.）》，2021年，第64卷。