遇见数据集

Large-scale annotation dataset for cell/tissue segmentation in H&E-stained images : anti-CD235a (red blood cells)

收藏
Mendeley Data2024-06-29 更新2024-06-28 收录
数据链接:
官方服务:

资源简介:

LICENSE This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC-BY-NC-SA 4.0) For non-commercial use, please use the dataset under CC-BY-NC-SA. If you would like to use the dataset for commercial purposes, please contact us (ishum-prm@m.u-tokyo.ac.jp). A Tar.gz file contains the following files: - HE image file: {antigen}_{celltype}_{slideID}_{posx}_{posy}_HE.png - Mask image file: {antigen}_{celltype}_{slideID}_{posx}_{posy}_mask.png Each image file is 984x984 px. posX and posY are the leftmost position in WSI coordinate. Mask files store binary segmentation mask (background : 0, target : 1) A csv file contains the following information: antigen : Antibodies for this antigen were used to create the segmentation mask. filename: filename of image or mask file. train_val_test : train, validation, or test sample in the paper.

### 许可协议 本作品采用知识共享署名-非商业性使用-相同方式共享4.0国际许可协议(Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International,CC-BY-NC-SA 4.0)进行授权。非商业使用场景下,请遵照CC-BY-NC-SA协议使用本数据集。若需将本数据集用于商业用途,请联系我们(邮箱:ishum-prm@m.u-tokyo.ac.jp)。 ### 压缩包文件说明 一个Tar.gz格式的压缩包内含以下两类文件: - 苏木精-伊红(HE)图像文件:命名规则为`{antigen}_{celltype}_{slideID}_{posx}_{posy}_HE.png`,其中`antigen`为抗原标识,`celltype`为细胞类型标识,`slideID`为玻片编号,`posx`与`posy`为全玻片图像(Whole Slide Image, WSI)坐标系下的最左侧位置坐标。 - 掩码图像文件:命名规则为`{antigen}_{celltype}_{slideID}_{posx}_{posy}_mask.png`。 所有图像文件的分辨率均为984×984像素。掩码文件为二值分割掩码,背景像素值为0,目标区域像素值为1。 ### 逗号分隔值(CSV)文件说明 一个CSV格式文件包含以下字段信息: - `antigen`:用于生成该分割掩码的抗体所靶向的抗原类型。 - `filename`:对应图像或掩码文件的文件名。 - `train_val_test`:标注该样本在本研究中属于训练集、验证集还是测试集。

创建时间:
2023-06-28
二维码
社区交流群
二维码
科研交流群
商业服务