CircaKB

CircaKB is a knowledgebase providing systematic genome-wide annotations of oscillatory gene expression patterns across 15 species, integrating 226 time-course transcriptome datasets from diverse tissues/organs. It offers 12 computational models for identifying circadian variations and supports custom analysis through search, visualization, and data upload tools.CircaKB是一款面向15个物种的全基因组节律基因表达模式提供系统性注释的知识库，整合了来自多种组织/器官的226份时间序列转录组数据集。该知识库提供12种用于识别昼夜节律变异的计算模型，并支持通过搜索、可视化及数据上传工具开展自定义分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CircaKB是一个综合性的昼夜节律基因知识库，整合了来自15个物种的226个时间序列转录组数据集，涵盖54种组织和23种实验条件。该知识库提供12种计算模型用于分析基因表达的昼夜振荡和差异节律性，并支持在线浏览和自定义分析工具。