lightonai/SwissProt-EC-leaf
收藏Hugging Face2022-05-05 更新2024-03-04 收录
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https://hf-mirror.com/datasets/lightonai/SwissProt-EC-leaf
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资源简介：
Swissprot是一个高质量的手动注释蛋白质数据库，包含蛋白质功能属性的注释。该数据集提取了带有酶委员会（EC）标签的蛋白质，并移除了没有叶级EC标签的蛋白质。叶级EC标签被提取并索引，映射关系在`idx_mapping.json`文件中提供。
Swissprot is a high-quality manually curated protein database with annotations of protein functional properties. This dataset extracts proteins bearing Enzyme Commission (EC) labels, and excludes those without leaf-level EC labels. Leaf-level EC labels are extracted and indexed, and the corresponding mapping is provided in the `idx_mapping.json` file.
提供机构：
lightonai
原始信息汇总
数据集概述
数据集名称
Swissprot
数据集内容
- 包含高质量的手动注释蛋白质序列。
- 蛋白质具有酶委员会（Enzyme Commission, EC）标签，用于描述其功能属性。
数据集特点
- 仅包含具有叶级EC标签的蛋白质，无叶级EC标签的蛋白质已被移除。
- 叶级EC标签的映射关系存储在
idx_mapping.json文件中。
示例
蛋白质Q87BZ2具有以下EC标签：
- EC:2.-.-.- (Transferases)
- EC:2.7.-.- (Transferring phosphorus-containing groups)
- EC:2.7.1.- (Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor)
- EC:2.7.1.30 (Glycerol kinase)
数据集中仅提取叶级标签，如EC:2.7.1.30，对应于甘油激酶。
