基于转录组序列的长柄双花木SSR标记开发
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-11-30 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
双花木属（Disanthus Maxim.）是金缕梅科（Hamamelidaceae）最原始的单种属,为东亚地区特有属。长柄双花木（D.cercidifolius var.longipes H.T.Chang）是日本特有植物双花木（D.cercidifolius Maxim.）的变种,仅分布于我国南方地区,为国家Ⅱ级保护植物,被列入我国濒危植物种名录,在研究金缕梅科系统发育和东亚植物区系地理演化等方面具有重要的科学价值。由于可利用的SSR标记引物数量不足,阻碍了长柄双花木遗传学研究。本研究对长柄双花木转录组序列进行高通量测序,采用de novo组装方法,共获得32325条unigene。利用MISA软件,搜索到13779个SSR位点,SSR位点发生频率为42.63%,位点分布频率为1/2.95 kb。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-11-30
