Pollen metabarcoding at Jerrabomberra wetlands

Pollen metabarcoding data from honeybee hives at Jerrabomberra wetlands, ACT. Markers used are ITS2 and trnL. Pollen sources are honey, pollen from bee bodies and pollen from pollen traps.\nLineage: DNA was extracted from pollen sources and amplified using primers listed below. Data was sequenced on an Illumina MiSeq using 2x250bp by Ramaciotti Centre for Genomics (UNSW), with funding from BioPlatforms Australia. \nPrimers used are:\nITS2-S2F:ATGCGATACTTGGTGTGAAT, Chen, et al. (2010)\nITS2-4 rev:TCCTCCGCTTATTGATATGC, White, et al. (1990)\ntrnL (UAA) p6 loop-g:GGGCAATCCTGAGCCAA, Baamrane, et al. (2012)\ntrnL (UAA) p6 loop-h:CCATTGAGTCTCTGCACCTATC, White, et al. (1990)\n

澳大利亚首都领地（ACT）杰拉布拉姆贝拉湿地（Jerrabomberra Wetlands）内蜜蜂蜂箱的花粉元条形码测序数据。本次研究所用的扩增标记为ITS2与trnL。花粉样本来源包括蜂蜜、蜜蜂体表附着花粉以及花粉捕集器采集的花粉。
实验流程：从上述花粉样本中提取基因组DNA，使用下文所列引物进行扩增；测序工作由新南威尔士大学（UNSW）拉马乔蒂基因组学中心（Ramaciotti Centre for Genomics）依托Illumina MiSeq测序平台，采用2×250bp双端测序策略完成，本项目经费由澳大利亚生物平台（BioPlatforms Australia）资助。
所用引物信息如下：
ITS2-S2F：ATGCGATACTTGGTGTGAAT，引自Chen等（2010）的研究
ITS2-4 rev：TCCTCCGCTTATTGATATGC，引自White等（1990）的研究
trnL (UAA) p6 loop-g：GGGCAATCCTGAGCCAA，引自Baamrane等（2012）的研究
trnL (UAA) p6 loop-h：CCATTGAGTCTCTGCACCTATC，引自White等（1990）的研究