introvoyz041/pgc-anxiety

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license: cc-by-4.0
task_categories:
- tabular-regression
- tabular-classification
tags:
- gwas
- summary-statistics
- psychiatric-genomics
- pgc
- anx
- mental-health
- genetics
- genomics
- biology
- health
- bioinformatics
pretty_name: PGC Anxiety Disorder GWAS Summary Statistics
size_categories:
- 1M-10M
configs:
- config_name: anx2016
default: true
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- split: train
path: data/anx2016/*.parquet
- config_name: anx2026
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- split: train
path: data/anx2026/*.parquet
- config_name: anx2026_GADsymptsQuant
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- split: train
path: data/anx2026_GADsymptsQuant/*.parquet
- config_name: panic2019
data_files:
- split: train
path: data/panic2019/*.parquet
language:
- en
source_datasets:
- pgc
---

# PGC Anxiety Disorder — GWAS Summary Statistics

[](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

## Dataset Description

Genome-wide association study (GWAS) summary statistics for **Anxiety Disorder** phenotypes from the [Psychiatric Genomics Consortium (PGC)](https://pgc.unc.edu/).

Each publication is available as a separate subset (config) and can be loaded independently.

## Usage

```python
from datasets import load_dataset

# Load a specific GWAS
ds = load_dataset("OpenMed/pgc-anxiety", "anx2016")
print(ds)
```

### List all available subsets

```python
from datasets import get_dataset_config_names
print(get_dataset_config_names("OpenMed/pgc-anxiety"))
```

## Subsets

| Config | Phenotype | Journal | Year | PubMed | Rows |
|--------|-----------|---------|------|--------|------|
| `anx2016` | Anxiety Disorders & Factors | Molecular Psychiatry | 2016 | [26754954](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26754954/) | — |
| `anx2026` | Anxiety Disorders (Case-Control) | Nature Genetics | 2026 | [39006447](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39006447/) | — |
| `anx2026_GADsymptsQuant` | GAD Symptoms (Quantitative) | Nature Human Behaviour | 2026 | Pending | — |
| `panic2019` | Panic Disorder | Molecular Psychiatry | 2019 | [31712720](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31712720/) | — |

## Data Format

All data is stored as **Apache Parquet** shards (10,000 rows each). Common columns:

| Column | Description |
|--------|-------------|
| `SNP` / `ID` | SNP rsID or variant identifier |
| `CHR` | Chromosome |
| `BP` / `POS` | Base-pair position (typically GRCh37/hg19) |
| `A1` | Effect allele |
| `A2` | Non-effect allele |
| `OR` / `BETA` | Odds ratio or effect size |
| `SE` | Standard error |
| `P` | P-value |
| `_source_file` | Original source filename |

> Column names vary between publications. Check each subset's schema.

## Citation

Please cite the original publication (see PubMed links above) and acknowledge the PGC:

> Data were obtained from the Psychiatric Genomics Consortium — https://pgc.unc.edu/

## Terms of Use

Released under **[CC BY 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)**.

- Cite the original publication(s)
- Do not attempt to re-identify individual participants
- Comply with the PGC [data use policies](https://pgc.unc.edu/for-researchers/data-access/)

## Source

- [Psychiatric Genomics Consortium (PGC)](https://pgc.unc.edu/)
- [PGC Downloads](https://pgc.unc.edu/for-researchers/download-results/)

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*Last updated: April 2026*

许可证：CC BY 4.0
任务类别：
- 表格回归（tabular-regression）
- 表格分类（tabular-classification）
标签：
- 全基因组关联研究（GWAS，Genome-Wide Association Study）
- 汇总统计量
- 精神基因组学
- 精神疾病基因组学联盟（PGC，Psychiatric Genomics Consortium）
- 焦虑相关（anx）
- 心理健康
- 遗传学
- 基因组学
- 生物学
- 健康
- 生物信息学
展示名称：PGC焦虑障碍全基因组关联研究汇总统计量
数据规模类别：
- 1M-10M
配置项：
- 配置名称：anx2016，默认启用，数据文件：
- 拆分方式：训练集，路径：data/anx2016/*.parquet
- 配置名称：anx2026，数据文件：
- 拆分方式：训练集，路径：data/anx2026/*.parquet
- 配置名称：anx2026_GADsymptsQuant，数据文件：
- 拆分方式：训练集，路径：data/anx2026_GADsymptsQuant/*.parquet
- 配置名称：panic2019，数据文件：
- 拆分方式：训练集，路径：data/panic2019/*.parquet
语言：
- 英语
源数据集：
- PGC

# PGC焦虑障碍 — 全基因组关联研究汇总统计量
[](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

## 数据集说明
本数据集包含来自[精神疾病基因组学联盟（PGC，Psychiatric Genomics Consortium）](https://pgc.unc.edu/)的焦虑障碍表型的全基因组关联研究（GWAS）汇总统计量。每一篇原始文献对应一个独立的子集（配置），可独立加载使用。

## 使用方法
python
from datasets import load_dataset

# 加载指定的全基因组关联研究数据集
ds = load_dataset("OpenMed/pgc-anxiety", "anx2016")
print(ds)

### 列出所有可用子集
python
from datasets import get_dataset_config_names
print(get_dataset_config_names("OpenMed/pgc-anxiety"))

## 子集详情
| 配置名称 | 表型 | 期刊 | 发表年份 | PubMed编号 | 数据行数 |
|--------|-----------|---------|------|--------|------|
| `anx2016` | 焦虑障碍及相关因子 | *Molecular Psychiatry* | 2016 | [26754954](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26754954/) | — |
| `anx2026` | 焦虑障碍（病例-对照研究） | *Nature Genetics* | 2026 | [39006447](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39006447/) | — |
| `anx2026_GADsymptsQuant` | 广泛性焦虑障碍（GAD，Generalized Anxiety Disorder）症状（定量表型） | *Nature Human Behaviour* | 2026 | 待公开 | — |
| `panic2019` | 惊恐障碍 | *Molecular Psychiatry* | 2019 | [31712720](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31712720/) | — |

## 数据格式
所有数据以**Apache Parquet**分片文件存储（每个分片包含10,000条记录）。通用字段说明如下：

| 字段名 | 字段含义 |
|--------|-------------|
| `SNP` / `ID` | SNP的rs编号或变异位点标识符 |
| `CHR` | 染色体编号 |
| `BP` / `POS` | 碱基对位置（通常采用GRCh37/hg19参考基因组版本） |
| `A1` | 效应等位基因 |
| `A2` | 非效应等位基因 |
| `OR` / `BETA` | 比值比（OR）或效应量 |
| `SE` | 标准误 |
| `P` | 显著性P值 |
| `_source_file` | 原始来源文件名 |

> 不同原始文献对应的字段名称可能存在差异，请查阅各子集的Schema信息。

## 引用规范
请引用对应原始文献（详见上文PubMed链接），并致谢精神疾病基因组学联盟（PGC）：
> 本数据集数据来源于精神疾病基因组学联盟 — https://pgc.unc.edu/

## 使用条款
本数据集基于**[CC BY 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)**协议发布：
- 请引用相关原始文献
- 不得尝试重新识别个体参与者
- 请遵守PGC的[数据使用政策](https://pgc.unc.edu/for-researchers/data-access/)

## 数据来源
- [精神疾病基因组学联盟（PGC，Psychiatric Genomics Consortium）](https://pgc.unc.edu/)
- [PGC数据集下载页面](https://pgc.unc.edu/for-researchers/download-results/)

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*最后更新时间：2026年4月*