MGnify

MGnify (formerly: EBI Metagenomics) offers an automated pipeline for the analysis and archiving of microbiome data to help determine the taxonomic diversity and functional & metabolic potential of environmental samples. Users can submit their own data for analysis or freely browse all of the analysed public datasets held within the repository. In addition, users can request analysis of any appropriate dataset within the European Nucleotide Archive (ENA). User-submitted or ENA-derived datasets can also be assembled on request, prior to analysis.

MGnify（原名：EBI 微生物组）提供了一套自动化流程，用于微生物组数据的分析与存档，旨在确定环境样本的物种多样性以及功能与代谢潜力。用户可提交自有数据进行分析，亦或自由浏览存储库中所有已分析的公共数据集。此外，用户还可请求对欧洲核酸档案（ENA）中任何合适的 dataset 进行分析。应用户要求，提交的或由 ENA 衍生的 dataset 亦可在分析前进行组装。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MGnify（原名EBI Metagenomics）是一个专注于微生物组数据的开放访问研究数据仓库，提供自动化分析管道以评估环境样本的分类学多样性和功能代谢潜力。它包含5,129项研究和573,344个样本，用户可提交数据、浏览公开数据集或请求分析欧洲核苷酸档案中的相关数据，但数据上传需注册。该仓库由非营利机构资助，支持生命科学和生物学等领域的研究。