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final_soap_GNV139000

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DataONE2014-06-05 更新2024-06-27 收录
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final_soap_GNV139000.fa: Assembly of Megathymus yuccae from Genbank SRA accession #SRR1299752, using multiple kmers (13,23,33,43,63) with SOAPdenovo-Trans v1.01. Different Kmer assemblies were combined with cd-hit-est and processed with the fastx toolkit. See Kawahara and Breinholt (2014) for more details.

final_soap_GNV139000.fa:该数据集为丝兰巨弄蝶(Megathymus yuccae)的转录组组装结果,其测序数据源自Genbank的SRA(Sequence Read Archive,序列读取档案)登录号SRR1299752。组装过程采用13、23、33、43、63共5种k聚体(k-mer)参数,并结合SOAPdenovo-Trans v1.01软件完成。随后通过cd-hit-est软件合并不同k聚体组装得到的结果,并使用fastx工具包进行后续数据处理。更多详细信息可参考Kawahara与Breinholt(2014)的相关研究。

创建时间:
2014-06-05
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