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Dataset 7.1 Liver matrix.isoforms.counts

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Mendeley Data2024-01-31 更新2024-06-27 收录
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Dataset 7 contains the raw gene/transcript counts data for each frog tissue sample (Experiment B, n = 61) resulting from allocation of sequence reads to genes from the transcriptome assemblies. These data are contained in Dataset 7, as 12 individual tab-separated text files (.txt) [Data Citation 1]. The four files for each tissue type (skin, liver and spleen) represent raw (1) counts, (2) TMM.EXPR files, (3) TPM.not_cross_norm files, and (4) normalisation information (as per the standard output from RSEM). The first row of these files (1-3 above) represents frog ID, and the first element of all subsequent rows represents transcript/isoform ID.

数据集7包含所有蛙类组织样本(实验B,n=61)的原始基因/转录本计数数据,此类数据来源于将测序读数分配至转录组组装所得到的基因的分析流程。该类数据以12个独立制表符分隔的文本文件(.txt,[数据引用1])的形式存储于数据集7中。针对皮肤、肝脏、脾脏这三种组织类型,每种组织对应4个文件:(1)原始计数文件、(2)TMM.EXPR文件、(3)TPM.not_cross_norm文件,以及(4)标准化信息文件(格式遵循RSEM的标准输出结果)。上述(1)至(3)类文件的首行为蛙样本ID,后续所有行的首个元素则为转录本/异构体(isoform)ID。

创建时间:
2024-01-31
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