National Cancer Institute's Genomic Data Commons

The National Cancer Institute’s (NCI’s) Genomic Data Commons (GDC) is a data sharing The National Cancer Institute's Genomic Data Commons (GDC) was created to promote precision medicine in oncology. It supports the import and standardization of genomic and clinical data from cancer research programs. The GDC contains NCI-generated data from some of the largest and most comprehensive cancer genomic datasets, including The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Therapies (TARGET). For the first time, these datasets have been harmonized using a common set of bioinformatics pipelines, so that the data can be directly compared. As a growing knowledge system for cancer, the GDC also enables researchers to submit data, and harmonizes these data for import into the GDC.

美国国家癌症研究所（National Cancer Institute, NCI）旗下的基因组数据共享中心（Genomic Data Commons, GDC）是一款专业数据共享平台，其创立初衷为推动肿瘤学领域的精准医学发展。该平台支持各类癌症研究项目产出的基因组与临床数据的导入与标准化工作。GDC收录了NCI生成的部分规模最大、覆盖最全面的癌症基因组数据集，包括癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）以及生成有效疗法的治疗适用研究（Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Therapies, TARGET）两大核心数据集。该平台首次采用一套通用的生物信息学流程（bioinformatics pipelines）对这些数据集进行统一整合，实现了不同数据集间的直接对比分析。作为持续迭代完善的癌症研究知识系统，GDC还支持研究人员提交数据，并对提交的数据进行标准化整合后导入至平台内部。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是美国国家癌症研究所（NCI）建立的基因组数据共享平台，旨在通过整合和标准化TCGA、TARGET等大型癌症基因组数据，促进肿瘤精准医疗研究。它提供统一的数据处理管道，支持数据的直接比较、提交、访问和分析，服务于癌症研究社区。