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final_soap_GNV129007

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DataONE2014-06-05 更新2024-06-27 收录
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final_soap_GNV129007.fa: Assembly of Urodus parvula from Genbank SRA accession #SRR1299750, using multiple kmers (13,23,33,43,63) with SOAPdenovo-Trans v1.01. Different Kmer assemblies were combined with cd-hit-est and processed with the fastx toolkit. See Kawahara and Breinholt (2014) for more details.

final_soap_GNV129007.fa:针对小尾平口鮠(Urodus parvula)的组装结果,数据来源于GenBank序列读取存档库(Sequence Read Archive,SRA)登录号SRR1299750,使用SOAPdenovo-Trans v1.01软件,采用13、23、33、43、63共5种不同的kmer值完成组装。将不同kmer值对应的组装结果通过cd-hit-est软件进行合并,并使用FASTX工具包(FASTX Toolkit)进行后续处理。详细研究细节可参见Kawahara与Breinholt (2014)的相关文献。

创建时间:
2014-06-05
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