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前列腺癌数据分析

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上海数据交易所2024-07-23 更新2024-12-16 收录
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https://nidts.chinadep.com/ep-hall/spec?id=5220&from=ep-hall-diseases
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官方服务:
资源简介:
前列腺癌是男性生殖系统中常见的恶性肿瘤,其发病率随年龄增长而上升。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。

Prostate cancer is a common malignant tumor in the male reproductive system, and its incidence rate increases with age. This dataset provides analytical pipelines for DNA, RNA and single-cell samples. Specifically, the DNA analysis workflow covers point mutation detection, structural variation analysis, fusion gene analysis and copy number variation (CNV) analysis. For RNA-seq analysis, in addition to differential gene expression analysis, it also includes novel transcript discovery, allele-specific expression analysis, and the interaction between transcripts and non-coding RNAs. Single-cell analysis encompasses cell type identification, intercellular communication analysis, single-cell trajectory inference and transcription factor analysis.
提供机构:
上海芯超数据科技有限公司
创建时间:
2024-07-23
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