UNITE USEARCH/UTAX/SINTAX release for Fungi

Reference file for USEARCH/UTAX/SINTAX. For optimized parameters and further information, please refer to the UTAX UNITE page. This is the "dynamic" release of the UNITE species hypotheses system, with singleton species hypotheses included. Any parts of the 18S and 28S are left in these sequences. This reference file can be used for ITS1-only or ITS2-only sequences if parameters trained on ITS1 or 2 only ('taxconfs' files) are used. ITS regions can be extracted using the ITSx tool.

适用于USEARCH、UTAX、SINTAX的参考文件。如需获取优化参数及更多相关信息，请参阅UTAX UNITE页面。本文件为UNITE物种假说（UNITE species hypotheses）系统的「动态版」发布包，并纳入了单例物种假说（singleton species hypotheses）。该参考文件中的序列保留了18S与28S区域的全部片段。若使用仅针对ITS1（内转录间隔区1，Internal Transcribed Spacer 1）或ITS2（内转录间隔区2，Internal Transcribed Spacer 2）训练得到的参数（即"taxconfs"文件），本参考文件可适配仅含ITS1或仅含ITS2的序列。可通过ITSx工具提取其中的ITS（内转录间隔区，Internal Transcribed Spacer）区域。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是针对真菌分类的USEARCH/UTAX/SINTAX参考文件，包含动态发布的UNITE物种假设系统（含单例物种假设），适用于ITS1或ITS2序列分析。数据集由UNITE社区发布，采用CC BY许可协议。