(16s) No 3. Diversity (16s rRNA) Output

Output files from the No 3. Diversity Workflow page of the Bocas Hypoxia
study.

File names and descriptions:

**16s-water.rdata:** contains all variables and phyloseq objects from the
pipeline. To see the **Objects** , in R run _load("16s-water.rdata",
verbose=TRUE)
_

**ps_water.rds** : Phyloseq object where _NA_ ranks renamed by next named
rank.

**ps_water_o.rds** : Phyloseq object with original _NA_ ranks.

**ps_water_ox.rds** : Same Phyloseq object as **ps_water_o.rds** but with
sample oxygen states added.

本数据集为博卡斯缺氧研究（Bocas Hypoxia study）第3号多样性工作流页面生成的输出文件。

文件名称及说明如下：

**16s-water.rdata**：包含该分析流程中的全部变量与phyloseq对象（phyloseq object）。若需查看其中包含的对象，可在R语言环境中执行代码`load("16s-water.rdata", verbose=TRUE)`。

**ps_water.rds**：phyloseq对象，其中原缺失值（NA）对应的分类阶元已通过下一级命名阶元完成重命名。

**ps_water_o.rds**：保留原始缺失值（NA）分类阶元的phyloseq对象。

**ps_water_ox.rds**：与**ps_water_o.rds**完全一致的phyloseq对象，额外添加了样本的氧状态信息。