PSI-MOUSE

PSI-MOUSE predicts mouse pseudouridine sites by combining conventional sequence-based features and 38 additional genomic features derived from the mouse genome, identifies putative Ψ sites with diverse types of post-transcriptional regulations (RNA-binding protein [RBP]-binding regions, miRNA-RNA interactions, and splicing sites) and collects 3282 experimentally validated mouse Ψ sites.PSI-MOUSE通过整合传统的基于序列的特征与源自小鼠基因组的38种额外基因组特征，实现小鼠假尿苷（Ψ）位点的预测；该模型可识别兼具多种转录后调控类型（RNA结合蛋白（RBP）结合区域、微小RNA（miRNA）-RNA相互作用及剪接位点）的推定Ψ位点，同时收录了3282个经实验验证的小鼠Ψ位点。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PSI-MOUSE是一个用于小鼠假尿苷（Ψ）位点预测的计算框架，它整合了传统序列特征与38个额外基因组特征，以提高预测准确性。该框架还提供基因注释、转录后分析功能，并包含3282个实验验证的Ψ位点，可作为探索调控机制的工具。