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小RNA序列信息原始数据集

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国家基础学科公共科学数据中心2026-01-30 收录
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https://nbsdc.cn/general/dataDetail?id=67279ee4195d2629e8afecef&type=1
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资源简介:
miRNA介导的转录后基因沉默是非编码RNA介导的基因沉默的重要方式,miRNA在体内受到多重调控,其中稳定性调控是miRNA介导沉默延续性重要调控环节。本项目针对植物miRNA稳定的调控机制开展了大规模的遗传学筛选,在获得重要突变体之后开展大规模小RNA测序,鉴定重要基因或蛋白质机器在miRNA稳定性调控中的作用。本数据集元数据主要为项目实施过程中所获取的小RNA测序数据,数据主要在项目执行期内(2017年至2018年期间),在北京诺禾致源科技股份有限公司与晶能生物技术(上海)有限公司由Illumina HiSeq 2500仪器产生。小RNA测序数据主要利用建库前RNA完整性控制(RIN值>7),原始数据的FastQC质控分析,cut-adaptor去除接头,并利用Bowite软件与小RNA数据库、参考基因组进行对比和分析开展整体质控。
提供机构:
复旦大学
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