RiceLncPedia

RiceLncPedia is a curated knowledgebase of rice lncRNAs that identified from over 2000 publically available RNA-Seq libraries. RiceLncPedia integrates genome variation, lncRNA-miRNA interaction, the precursors of miRNAs, transposable elements (TE) related lncRNAs and the association of lncRNAs with agricultural traits. The current version of RiceLncPedia houses 6,965 rice lncRNAs, and provides expression profiles across 2,312 RNA-seq libraries.

RiceLncPedia是一个针对水稻长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）的人工精选知识库，其收录的lncRNA均从超过2000个公开可用的RNA测序（RNA-Seq）文库中鉴定得到。该知识库整合了基因组变异信息、lncRNA与microRNA（miRNA）的互作关系、miRNA前体序列、转座因子（transposable element，TE）相关lncRNA，以及lncRNA与农业性状的关联。当前版本的RiceLncPedia共收录6965条水稻lncRNA，并提供了来自2312个RNA-Seq文库的表达谱数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

RiceLncPedia是一个专注于水稻长链非编码RNA（lncRNAs）的精选知识库，包含6965个lncRNAs及其多组学数据。该数据库提供了丰富的功能，如表达谱分析、变异检测、相互作用网络等，并支持数据下载和搜索，为研究水稻lncRNAs提供了全面的资源。