干旱胁迫下丛枝菌根共生诱导甘草（Glycyrrhiza uralensis Fisch.）酚类及黄酮类物质积累的转录组与代谢组整合研究原始数据

本套数据为解析干旱胁迫下丛枝菌根（Arbuscular Mycorrhiza，AM）共生对甘草（Glycyrrhiza uralensis Fisch.）酚类和黄酮类物质特异性积累的分子调控机制提供支撑，涵盖植物生长表型、代谢组及转录组原始数据，具体如下：
数据内容
本研究的植物为甘草（Glycyrrhiza uralensis Fisch.），属于豆科甘草属多年生草本植物，是我国传统药用植物，其根和根茎富含甘草酸、甘草苷等酚类及黄酮类活性成分，具有抗炎、免疫调节等药用价值，也是干旱半干旱地区重要的生态修复植物。
植物生长表型数据（1 basic data_plant growth.xlsx）：包含落叶比、地上部 / 根系鲜重 / 干重、生物量降低幅度、含水量、根冠比、菌根依赖度、侵染率等 17 项关键指标，记录不同处理组（AMF/NMF×WW/MD）的混样编号、盆数及具体数值，直接反映植物地上部与根系的生长状态及菌根共生效应；
代谢组原始数据（2 metabolome raw_data.xlsx）：基于 LC-MS (-) 检测，包含 528 个代谢物特征（含质荷比 m/z、保留时间 rt）及对应样本（NW：NMF+WW；ND：NMF+MD；AW：AMF+WW；AD：AMF+MD）的相对含量，表征植物在不同处理下的代谢物响应规律。“2 metabolome raw_data.xlsx” 中 528 个 “代谢物特征” 并非仅以序号（No.1-No.528）表示，每个序号对应完整的代谢物化学特征信息：包括质荷比（m/z）、保留时间（rt，单位：min），以及基于 LC-MS (-) 检测的相对丰度值（不同处理样本中）。其中，312 个特征通过比对 HMDB（Human Metabolome Database）、KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）等数据库，已注释为已知酚类（如香豆素、木脂素）和黄酮类（如黄酮醇、异黄酮）物质（如序号 No.42 对应甘草苷，m/z=417.112，rt=8.32 min；序号 No.156 对应阿魏酸，m/z=193.054，rt=5.67 min）；其余 216 个特征为暂未注释的潜在新型酚类 / 黄酮类衍生物，其 m/z 和 rt 参数可通过质谱数据库进一步追溯鉴定。
转录组原始数据（3 RNA-seq raw_data.xls）：包含各处理组植物样本的基因测序原始读数（Raw Reads）、过滤后读数（Clean Reads）等，反映基因表达差异，为挖掘关键调控基因提供基础。
数据来源及加工方法数据来源于实验室可控栽培实验：以 “菌根接种（AMF/NMF）+ 水分（WW/MD）” 为双变量设置 4 个处理组，每组设 2-3 盆重复并进行混样；植物生长指标通过电子天平（鲜重 / 干重测定）、烘干箱（含水量测定）、显微镜观察（侵染率统计）获取；代谢组数据通过超高效液相色谱 - 串联质谱（UHPLC-MS/MS）检测：采用 Waters ACQUITY UPLC BEH C18 色谱柱（2.1×100 mm，1.7 μm），流动相为 0.1% 甲酸水（A）和 0.1% 甲酸乙腈（B），梯度洗脱（0-1 min，5% B；1-9 min，5%-95% B；9-10 min，95% B；10-11 min，95%-5% B；11-14 min，5% B），流速 0.3 mL/min，柱温 40℃；质谱采用电喷雾负离子模式（ESI⁻），扫描范围 m/z 50-1000。528 个代谢物特征通过 Progenesis QI 软件提取，序号（No.1-No.528）按保留时间由小到大排序，便于数据管理，其对应的 m/z 和 rt 参数均经过仪器校准（误差＜5 ppm）；转录组数据通过高通量测序仪测定，生成原始测序文件；所有数据经人工核对重复样本一致性、剔除异常值后，整理为规范 Excel/xls 表格格式。
数据质量描述数据可靠性高：植物生长指标每组设 3 次重复测定，关键指标（如地上部干重、根系干重）变异系数（CV）＜10%；代谢组数据的 m/z 与 rt 参数经仪器校准，相对含量 CV＜15%；转录组数据测序质量值 Q30＞90%，碱基分布均匀，无接头污染或碱基偏好性；所有数据无缺失值，格式统一，可直接用于后续统计分析。528 个代谢物特征的检测重复性良好：同一质控样本（QC）中，特征峰面积的相对标准偏差（RSD）＜10%；已注释的 312 个酚类 / 黄酮类物质通过标准品验证（如甘草酸标准品保留时间偏差＜0.1 min，m/z 偏差＜2 ppm），确保定性准确性；未注释的 216 个特征均满足 “连续 3 次检测出峰”“信噪比（S/N）＞10” 的筛选标准，数据可靠性可追溯。
数据应用成果及前景目前可用于：通过生长表型数据验证菌根对植物抗旱性的提升作用（如根冠比、含水量差异）；基于代谢组数据筛选干旱响应关键代谢物（如通过 PCA/PLS-DA 分析差异代谢物）；结合转录组数据挖掘菌根共生相关基因（如 DESeq2 筛选差异表达基因）。528 个代谢物特征可直接用于：通过差异分析筛选 AM 共生调控的特异性酚类 / 黄酮类物质（如对比 AM 接种与非接种组的特征丰度差异）；结合转录组数据构建 “基因 - 代谢物” 调控网络（如分析 CHS 基因表达与黄酮类特征 No.42（甘草苷）的相关性）；未注释特征为发现甘草新活性成分提供线索，可推动药用植物代谢组学研究。