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SPMP HiC bins

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DataCite Commons2022-05-12 更新2024-07-29 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/SPMP_HiC_bins/19754053
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资源简介:
Bins (high, near complete, medium and low quality) from a subset of 24 Singaporean gut metagenome from SPMP assembled with Illumina and Nanopore reads (opera-ms) and binned with Hi-C data.

本数据集包含来自新加坡人群宏基因组计划(Singapore Population Metagenome Project, SPMP)中24例新加坡人肠道宏基因组子集的不同质量等级的基因组分箱(bin),质量等级涵盖高质量、近完整、中等质量与低质量;所有样本均采用Illumina与Nanopore测序读段,并借助opera-ms工具完成组装,随后利用Hi-C数据完成基因组分箱。
提供机构:
figshare
创建时间:
2022-05-12
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集包含来自24个新加坡肠道宏基因组的高、接近完整、中等和低质量的bins,使用Illumina和Nanopore reads进行组装,并通过Hi-C数据进行分箱。数据集发布于2022年5月12日,属于生物信息学和计算生物学领域,采用CC BY 4.0许可证。
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