化合物-通道互作模拟、抗癫痫机制及机制数据集
收藏国家基础学科公共科学数据中心2026-04-04 收录
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本数据集依托国家重点研发计划“战略性科技创新合作”专项项目“KCNQ5通道选择性调控剂发现及其治疗癫痫等神经精神疾病的功能研究”(项目编号:2022YFE0205600)产生。数据集面向先导化合物作用机制研究的科学需求建设,旨在为阐明化合物与KCNQ5通道的互作模式及其抗癫痫分子机制提供系统的计算与实验数据支撑。 数据集于2024年5月至2025年10月在华东师范大学超算中心、生命科学学院实验室及澳门科技大学实验室,通过分子动力学模拟(GROMACS软件)、点突变结合膜片钳技术(Axon膜片钳系统)采集与加工产生。主要内容包括:2-3个活性化合物与KCNQ通道复合物的分子动力学模拟轨迹(14套,.xtc格式)、结合自由能计算数据、轨迹动态分析结果(RMSD、配体-蛋白相互作用残基氢键数据、螺旋距离和孔道大小分析,.xlsx格式)、关键作用位点突变验证的电生理原始数据(.abf格式),以及支撑机制研究论文的PDF全文和全部模拟与实验图表的原始数据。数据集总数据量约为22.5 GB。本数据集的建立,为先导化合物与KCNQ通道的互作模式解析提供了高精度的模拟数据,也为抗癫痫新机制的揭示和后续药物优化奠定了数据基础。
提供机构:
华东师范大学搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集整合了分子动力学模拟与电生理实验数据,旨在解析活性化合物与KCNQ5通道的相互作用模式及抗癫痫分子机制。内容包括KCNQ-化合物复合物的分子动力学轨迹、结合自由能、残基作用分析及关键位点突变验证的电生理原始数据,总数据量约22.5 GB,为先导化合物的机制研究和药物优化提供了基础数据支撑。
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