Data for: 5-gene differential expression predicts stability of human intestinal allografts
收藏Mendeley Data2024-01-31 更新2024-06-26 收录
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https://data.mendeley.com/datasets/wwhdy98hkc
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资源简介：
The zip file includes: • “1-edgeR_DEGs.R”: the script for differential analysis. • “2-pamr.R”: the script for gene selection by nearest shrunken centroids method. • “3-MLSeq.R”: the script for the validation of the 5-genes set by SVM, bagSVM and random forest methods. • “4-logistic_regression.R”: the script for logistic regression and validation for the qPCR results. • “qPCR_results.txt”: the relative expression values (calculated as 2-ΔCt) of all qPCR samples.
该压缩包包含以下内容：
• 1-edgeR_DEGs.R：用于差异表达分析的R脚本
• 2-pamr.R：基于最近收缩质心法进行基因筛选的R脚本
• 3-MLSeq.R：用于通过支持向量机（Support Vector Machine，SVM）、袋装支持向量机（bagSVM）以及随机森林方法对5基因特征集进行验证的R脚本
• 4-logistic_regression.R：用于逻辑回归分析以及对实时定量聚合酶链反应（quantitative real-time polymerase chain reaction, qPCR）结果进行验证的R脚本
• qPCR_results.txt：所有qPCR样本的相对表达量（以2-ΔCt法计算得到）
创建时间：
2024-01-31
