Structural data of drug molecules for force field AMBER99 used for MD simulations of solubilization into taurocholate/DOPC micelles

The dataset includes the following files for the molecules of fenofibrate, progesterone, 17-OH-progesterone, albendazole, paracetamol and ibuprofen: 1) pdb files of the drug molecules after optimization with DFT functional B3LYP and basis set 6-31G*. 2) itp files for AMBER99 force field in GROMACS software. 3) ffbonded_drugs.dat includes extra added bonded paramters for the simulated molecules adopted from GAFF or similar structures. 4) TC_drugs_structures.dat inclueds the information from the rtp file of the force field.本数据集包含非诺贝特（fenofibrate）、孕酮（progesterone）、17-羟孕酮（17-OH-progesterone）、阿苯达唑（albendazole）、对乙酰氨基酚（paracetamol）及布洛芬（ibuprofen）六种药物分子对应的如下文件： 1) 采用密度泛函理论（Density Functional Theory, DFT）B3LYP泛函与6-31G*基组完成结构优化后的药物分子PDB（Protein Data Bank）格式文件。 2) 适配GROMACS软件中AMBER99力场的ITP文件。 3) ffbonded_drugs.dat文件收录了从GAFF（General Amber Force Field）或相似结构中提取的、用于模拟上述药物分子的额外键合参数。 4) TC_drugs_structures.dat文件包含了该力场rtp文件中的相关信息。