Conjunto de dados para análise de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche (OROV) entre 1955–2024 e variantes brasileiras de 2023–2024

Este conjunto de dados reúne arquivos de sequências genômicas e scripts utilizados em análises bioinformáticas para identificação de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche (OROV). As sequências utilizadas nas análises foram obtidas a partir do banco de dados público do National Center for Biotechnology Information (NCBI), incluindo registros depositados entre os anos de 1955 e 2024. Essas sequências foram organizadas de acordo com os três segmentos genômicos do vírus Oropouche (L, M e S). As sequências foram submetidas a alinhamento múltiplo utilizando o software MAFFT, executado em ambiente Linux (Ubuntu) por meio do Windows Subsystem for Linux (WSL). Após o alinhamento, scripts desenvolvidos em Python foram utilizados para identificar mutações presentes nas sequências analisadas. Esses scripts foram executados por meio do PowerShell e permitiram identificar mutações semelhantes e não semelhantes, bem como determinar as posições dessas mutações ao longo das sequências analisadas. A análise incluiu a avaliação de mutações acumuladas ao longo do tempo em sequências depositadas entre 1955 e 2024. Além da análise temporal, também foram incluídas sequências brasileiras do vírus Oropouche coletadas entre 2023 e 2024. Essas sequências foram comparadas com cepas de referência, incluindo a cepa BeAn19991 e a variante AM0088, permitindo identificar mutações presentes nas variantes recentes que não estavam presentes nas cepas de referência. Os arquivos disponibilizados neste dataset incluem: conjuntos de sequências utilizados nas análises bioinformáticas; scripts utilizados para identificação de mutações nos segmentos genômicos L, M e S; dados referentes à análise temporal de sequências de OROV depositadas entre 1955 e 2024 e dados referentes à análise comparativa de sequências brasileiras de 2023–2024 Este conjunto de dados foi gerado no contexto de uma dissertação de mestrado voltada ao estudo da evolução molecular e do acúmulo de mutações nos segmentos genômicos do vírus Oropouche.本数据集汇集了用于鉴定奥罗普切病毒（Oropouche, OROV）基因组片段突变的生物信息学分析所用的基因组序列文件与分析脚本。本研究使用的序列取自美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information, NCBI）公共数据库，涵盖1955年至2024年间提交的全部登记记录。上述序列按照奥罗普切病毒的三个基因组片段（L、M、S片段）完成分类整理。 序列多序列比对采用MAFFT软件完成，运行环境为基于Windows子系统Linux（Windows Subsystem for Linux, WSL）搭建的Ubuntu Linux系统。比对完成后，通过PowerShell运行自研Python脚本，实现对目标分析序列中突变的鉴定：该脚本可区分相似与非相似突变，并精确定位突变在分析序列中的具体位置。本次分析包含对1955年至2024年间提交序列的随时间累积突变情况的评估。 除时序演化分析外，本数据集还纳入了2023年至2024年间采集的巴西奥罗普切病毒序列。将上述序列与参考毒株（包括BeAn19991毒株与AM0088变异株）进行比对，可识别出近期变异株中存在而参考毒株未携带的特异性突变。 本数据集提供的文件包括：用于生物信息学分析的序列数据集、用于鉴定L、M、S片段基因突变的分析脚本、1955年至2024年间奥罗普切病毒序列的时序分析数据，以及2023-2024年巴西奥罗普切病毒序列的比对分析数据。 本数据集源自一项针对奥罗普切病毒基因组片段分子进化与突变积累的硕士学位论文研究工作。