OLD Données relatives aux résultats des tests virologiques COVID-19

⚠️ Cette ressource n'est plus actualisée depuis le 18 mai 2022. Le format des ressources issues des données de laboratoires pour le dépistage (SI-DEP) évolue. L'ensemble des ressources au nouveau format sont centralisées dans le nouveau jeu de données dédié : ➡️ https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-de-laboratoires-pour-le-depistage-a-compter-du-18-05-2022-si-dep/ Merci à nos utilisateurs pour leur compréhension Information du 20 mai 2021 A compter de ce jour, les indicateurs seront corrigés afin de supprimer l’effet doublon, lors de la réalisation de plusieurs tests de dépistage par une même personne. Depuis le début de la pandémie, la plateforme sécurisée Si-DEP enregistre tous les résultats des tests de dépistage. Afin de garantir la protection des données personnelles des personnes testées, chaque résultat était lié à l’émission d’un pseudo anonymisé. Cependant, avec l’apparition des variants sur le territoire, certaines personnes sont amenées à réaliser deux tests, jusqu’à présent comptabilisés deux fois. L'algorithme utilisé a donc récemment été mis à jour afin qu’il ne décompte qu’un seul patient lorsque celui-ci se fait tester plusieurs fois dans un intervalle de temps court, toujours en respectant l'anonymat. Grâce à cette nouvelle pseudonymisation, Santé publique France est capable de renforcer son efficacité et de produire des données encore plus précises, consultables chaque semaine dans son point épidémiologique. Les actions de Santé publique France Santé publique France a pour mission d'améliorer et de protéger la santé des populations. Durant la crise sanitaire liée à l'épidémie du COVID-19, Santé publique France se charge de surveiller et comprendre la dynamique de l'épidémie, d'anticiper les différents scénarii et de mettre en place des actions pour prévenir et limiter la transmission de ce virus sur le territoire national. Le Système d’Informations de DEPistage (SI-DEP) Le nouveau système d’information de dépistage (SI-DEP), en déploiement depuis le 13 mai 2020, est une plateforme sécurisée où sont systématiquement enregistrés les résultats des laboratoires des testsréalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2. La création de ce système d'information est autorisée pour une durée de 6 mois à compter de la fin de l'état d'urgence sanitaire par application du décret n° 2020-551 du 12 mai 2020 relatif aux systèmes d’information mentionnés à l’article 11 de la loi n° 2020-546 du 11 mai 2020 prorogeant l’état d’urgence sanitaire et complétant ses dispositions. Description des données Le présent jeu de données renseigne à l'échelle départementale et régionale : le nombre de personnes testées et le nombre de personnes déclarées positives par classe d'âge (quotidien et hebdomadaire) ; le nombre de personnes positives sur 7 jours glissants. Le présent jeu de données renseigne à l'échelle nationale : le nombre de personnes testées et le nombre de personnes déclarées positives par sexe et classe d'âge (quotidien et hebdomadaire). Le taux de positivité correspond au nombre de tests positifs rapportés au nombre de tests réalisés. Il est calculé de la manière suivante : 100*nombre de test positif/ nombre de tests réalisés Précisions : Si plusieurs prélèvements sont rapportés pour un même patient: A compter du 29/08, les indicateurs issus des données de laboratoires (SI-DEP) présentent des taux d’incidence, de positivité et de dépistage corrigés en fonction des dépistages réalisés dans les aéroports à l’arrivée des vols internationaux. La correction s’applique sur l’ensemble des données postérieures à la date du 12 août. Limites : Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles le département de résidence a pu être localisé sont représentés sur les cartes. Les personnes dont le département n’a pas pu être remonté dans les données SIDEP ne sont comptabilisées qu'au niveau France entière. De ce fait la somme des tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre de tests indiqué en France. Le délai de remontée des tests peut excéder 9 jours dans certains cas. Les indicateurs sont ajustés quotidiennement selon la réception des résultats. Pour en savoir plus consultez la note méthodologique disponible dans les ressources. Changements notables Depuis le 8 décembre, après avoir vérifié la qualité des données remontées, tous les résultats de tests RT-PCR ou Antigéniques, entrent dans la production des indicateurs épidémiologiques nationaux et territoriaux (taux d’incidence, taux de positivité et taux de dépistage) utiles au suivi de l’épidémie de COVID-19. Par ailleurs, l’épidémie se prolonge dans le temps et les capacités de dépistage ont augmenté, ce qui conduit à une fréquence croissante de personnes testées plusieurs fois. Ainsi, un ajustement des méthodes de dédoublonnage pour les patients bénéficiant de tests répétés et donc de la définition des personnes testées étaient nécessaires. Santé publique France, dans son approche épidémiologique centrée sur les patients, a donc adapté ses méthodes pour que ces indicateurs reflètent notamment au mieux la proportion de personnes infectées parmi la population testée. Ces évolutions n’ont pas d’impact sur les tendances et l’interprétation de la dynamique de l’épidémie, qui restent identiques. Des données plus précises relatives aux tests (incidence et positivité) sont également publiées par Santé publique France (données SI-DEP).

⚠️ 本资源自2022年5月18日起已不再更新。实验室检测数据（SI-DEP）的资源格式已发生变化。所有新的资源格式均集中在新数据集中：➡️ https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-de-laboratoires-pour-le-depistage-a-compter-du-18-05-2022-si-dep/ 感谢用户的理解。信息更新于2021年5月20日，自今日起，指标将进行调整，以消除重复测试的效果，当同一人在进行多次检测时。自疫情爆发以来，安全平台Si-DEP已记录所有检测测试结果。为确保检测人员的个人信息安全，每个结果都与一个匿名化标识符相关联。然而，随着变异株在本地的出现，某些人需要接受两次检测，此前都被计为两次。因此，近期该算法已更新，以确保在短时间内多次检测同一患者时，仅计算一个患者，同时仍保持匿名性。得益于这种新的匿名化方法，法国公共卫生局能够提高其工作效率，并产生更为精确的数据，这些数据每周可在其流行病学报告中查阅。法国公共卫生局的行动法国公共卫生局的使命是提升和保护民众的健康。在COVID-19卫生危机期间，法国公共卫生局负责监测和了解疫情动态，预测不同的情景，并采取行动预防及限制病毒在国内的传播。DEPistage信息系统（SI-DEP）自2020年5月13日起部署的新DEPistage信息系统（SI-DEP）是一个安全平台，所有城市实验室和医院机构进行的SARS-COV2检测结果都会在这里系统性地记录。该信息系统的创建是根据2020年5月12日第2020-551号法令，授权自卫生紧急状态结束之日起6个月内实施，该法令适用于《2020年5月11日第2020-546号法令》第11条所提及的信息系统，并延长了卫生紧急状态，并补充了其规定。数据描述本数据集按部门和地区尺度提供以下信息：每日和每周按年龄段划分的检测人数和阳性人数；7日滑动窗口内的阳性人数。按国家尺度，本数据集提供以下信息：每日和每周按性别和年龄段划分的检测人数和阳性人数。阳性率是指阳性测试数量与测试总数之比。计算方法如下：100*阳性测试数量/测试总数。细节说明：如果同一患者报告了多个样本，自2020年8月29日起，实验室数据（SI-DEP）中的指标（发病率、阳性率和检测率）将根据国际航班到达时的机场检测进行调整。这种调整适用于8月12日之后的所有数据。局限性：仅在居住地部门能够被定位的人员的生物检测数据在地图上表示。在SIDEP数据中未能返回部门的人员仅在法国层面进行计数。因此，部门和地区的测试总数低于法国层面的测试总数。在某些情况下，测试的回报时间可能超过9天。指标根据结果的接收每日进行调整。更多详情请参阅方法学资源。显著变化自12月8日起，在验证数据质量后，所有RT-PCR或抗原测试结果均纳入国家及地区流行病学指标（发病率、阳性率和检测率）的生产中，这些指标有助于COVID-19疫情的跟踪。此外，疫情持续时间延长，检测能力增强，导致重复检测的人数频率增加。因此，需要对重复检测患者的去重方法和检测人员的定义进行调整。法国公共卫生局在其以患者为中心的流行病学方法中，因此调整了其方法，以确保这些指标能够最大限度地反映在检测人群中感染者的比例。这些变化不会对疫情动态的趋势和解释产生影响，它们保持不变。法国公共卫生局还发布了与测试相关的更精确数据（发病率和阳性率）。