Sample Datasets For Galaxy Rna-Seq Tutorial

This is downsampled dataset from http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2016.095. It was prepared as follows: Mapping data from http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2016.095 against hg38 using HISAT2 Restricting resulting BAM datasets to chrX:70,000,000-80,000,000 Extracting reads using picard SamToFastq tool File rnaseq_sex.tab contains mapping between accession numbers and sex of the sequences individuals.本数据集为源自 http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2016.095 的降采样版本，其制备流程如下： 使用 HISAT2 将 http://dx.doi.org/10.1038/nprot.2016.095 中的原始测序比对数据比对至人类参考基因组hg38 将生成的BAM（Binary Alignment Map）数据集限定至chrX染色体的70,000,000至80,000,000区间 使用Picard工具包中的SamToFastq工具提取测序读段（reads） 文件rnaseq_sex.tab 收录了测序个体的登录号与性别对应关系。