unpublished dataset (Seurat Object) for Vcl ENCC and CNCC project
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library(Seurat) # seurat object for vcl ENCC print(load("keyRdata/vcl.encc.integrated.Rdata")) # annotation subtypes in each lineage table(vcl.combined$lineage.sub) # condition, normal vs Vcl cKO ENCC table(vcl.combined$stage) ####################### # seurat object for vcl CNCC print(load("E13.5_CNCC_merged_updated.Rdata")) # sample, ct2 is control and vcl is Vcl cKO CNCC table(seuset$orig.ident) # cell annotation file # unsupervised clusters, see more information in HKU thesis table(all_tsne$ident)
library(Seurat) # 用于vcl ENCC的Seurat对象 print(load("keyRdata/vcl.encc.integrated.Rdata")) # 加载并打印整合后的vcl ENCC Seurat对象数据 # 各细胞谱系的注释亚型 table(vcl.combined$lineage.sub) # 实验分组：正常组与Vcl基因条件性敲除（Vcl cKO）ENCC组 table(vcl.combined$stage) ####################### # 用于vcl CNCC的Seurat对象 print(load("E13.5_CNCC_merged_updated.Rdata")) # 加载并打印更新后的E13.5期整合CNCC Seurat对象数据 # 样本分组：ct2为对照组，vcl为Vcl cKO CNCC组 table(seuset$orig.ident) # 细胞注释文件 # 无监督聚类结果，详细信息参见香港大学学位论文（HKU thesis） table(all_tsne$ident)
