SARS-CoV-2 Sequenzdaten aus Deutschland

Für die Planung von Maßnahmen zur Eindämmung von COVID-19 kommt der genauen Kenntnis der Eigenschaften von SARS-CoV-2 eine zentrale Bedeutung zu. Eine besondere Rolle spielen in diesem Zusammenhang Mutationen des Virus. Für eine erfolgreiche Eindämmung der Pandemie ist es daher entscheidend, einen detaillierten Überblick über die Ausbreitungsmuster spezifischer SARS-CoV-2-Mutationen zu erhalten und auch neue Mutation frühzeitig zu entdecken.<br>Hierfür stellt das Robert Koch-Institut die Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln. Technisch erfolgt diese Übermittlung über den Deutschen Elektronischen Sequenzdaten-Hub (DESH).<br>Im Projekt "OSEDA - Offene Sequenzdaten" verpflichtet sich das RKI, die aufgearbeiteten und qualitätskontrollierten Sequenzdaten zusammen mit einer Auswahl von klinisch-epidemiologischen Daten über die öffentlich zugängliche Repositorien des European Nucleotide Archive) und GISAID für weitere Forschungsvorhaben bereitzustellen.在制定新型冠状病毒肺炎（COVID-19）防控举措时，精准掌握新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的各项特性具有核心意义。在此背景下，病毒突变发挥着尤为关键的作用。因此，成功遏制新冠大流行的关键在于，全面掌握特定SARS-CoV-2突变株的传播模式，并及早识别新型突变。 为此，罗伯特·科赫研究所（Robert Koch-Institut）搭建了覆盖全德范围的分子监测体系。依据《新型冠状病毒SARS-CoV-2分子遗传监测条例》，德国境内所有完成SARS-CoV-2测序的实验室，均有义务向罗伯特·科赫研究所提交测序数据及相关元数据。该数据报送的技术流程依托德国电子序列数据中心（Deutscher Elektronischer Sequenzdaten-Hub, DESH）完成。 在“OSEDA - 开放序列数据（Offene Sequenzdaten）”项目中，罗伯特·科赫研究所承诺，将经过整理优化与质量管控的测序数据，连同筛选后的临床流行病学数据集，通过欧洲核苷酸档案库（European Nucleotide Archive）与全球流感数据共享平台（GISAID）两大公开数据库，对外共享以供后续科研活动使用。