Molecular dynamics simulations of wild-type and A120L transthyretin
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Two MD trajectories (wild-type tetramer and A120L tetramer) simulated using Amber 16 and AMBER ff14SB force field for the following paper: Mispacking of the F87 sidechain drives aggregation-promoting conformational fluctuations in the subunit interfaces of the transthyretin tetramer, X. Sun*, J. A. Ferguson*, K. Yang*, R. L. Stanfield, H. J. Dyson, P. E. Wright, Prot. Sci., 2024, 33(9): e5101. *: equal contribution. https://doi.org/10.1002/pro.5101
本数据集包含两条分子动力学（Molecular Dynamics, MD）轨迹，分别为野生型四聚体与A120L突变型四聚体，借助Amber 16软件与AMBER ff14SB力场完成模拟，相关研究论文信息如下： 《F87侧链错配驱动运甲状腺素蛋白四聚体亚基界面的聚集促进构象波动》，作者X. Sun*、J. A. Ferguson*、K. Yang*、R. L. Stanfield、H. J. Dyson、P. E. Wright，发表于《蛋白质科学（Protein Science）》2024年，第33卷第9期，文章编号为e5101。其中*代表作者贡献均等。 相关DOI链接：https://doi.org/10.1002/pro.5101
