An unexpected mode of small molecule DNA binding provides the structural basis for DNA cleavage by the potent antiproliferative agent (-)-lomaiviticin A

An unexpected mode of small molecule DNA binding provides the structural basis for DNA cleavage by the potent antiproliferative agent (-)-lomaiviticin A Descriptor: (1R,1'R,2S,2'S,3R,3'R,5aR,10aR,11a'S)-2'-[(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)oxy]-2,2'-diethyl-11,11 '-dihydrazinyl-6,6',9,9'-tetrahydroxy-4,4',5,5',10,10'-hexaoxo-1,1'-bis{[2,4,6-trideoxy-4-(dimethylamino)-beta-L-arabino -hexopyranosyl]oxy}[2,2',3,3',4,4',5,5',5a,8,10,10',10a,11a'-tetradecahydro-1H,1'H-[3,3'-bibenzo[b]fluorene]]-2-yl 2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside, DNA (5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3') Authors: Woo, C.M, Li, Z, Paulson, E, Herzon, S.B. Deposit date: 2015-11-07 Release date: 2016-06-01 Last modified: 2024-05-15 Method: SOLUTION NMR Cite: Structural basis for DNA cleavage by the potent antiproliferative agent (-)-lomaiviticin A. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 113, 2016

小分子与DNA结合的一种非常规模式，为强效抗增殖剂(-)-洛马霉素A ((-)-lomaiviticin A)切割DNA提供了结构基础
结构描述：(1R,1'R,2S,2'S,3R,3'R,5aR,10aR,11a'S)-2'-[(2,6-二脱氧-3-O-甲基-α-L-阿拉伯糖型己吡喃糖基)氧基]-2,2'-二乙基-11,11'-二肼基-6,6',9,9'-四羟基-4,4',5,5',10,10'-六氧代-1,1'-双{[2,4,6-三脱氧-4-(二甲氨基)-β-L-阿拉伯糖型己吡喃糖基]氧基}[2,2',3,3',4,4',5,5',5a,8,10,10',10a,11a'-十四氢-1H,1'H-[3,3'-联苯并[b]芴]]-2-基 2,6-二脱氧-3-O-甲基-α-L-阿拉伯糖型己吡喃糖苷，脱氧核糖核酸(DNA)：5'-D(*GP*CP*TP*AP*TP*AP*GP*C)-3'
作者：Woo, C.M、Li, Z、Paulson, E、Herzon, S.B.
提交日期：2015年11月7日
发布日期：2016年6月1日
最后修改日期：2024年5月15日
实验方法：溶液核磁共振（SOLUTION NMR）
引用文献：《强效抗增殖剂(-)-洛马霉素A切割DNA的结构基础》. 《美国国家科学院院刊》(Proc. Natl. Acad. Sci. USA), 113卷, 2016年