Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike (HexaPro variant) in complex with nanobody W25 (map 3, focus refinement on RBD, W25 and adjacent NTD)

Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike (HexaPro variant) in complex with nanobody W25 (map 3, focus refinement on RBD, W25 and adjacent NTD) Descriptor: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, Spike glycoprotein, ... Authors: Lauer, S, Spahn, C.M.T, Schwefel, D. Deposit date: 2022-10-21 Release date: 2023-03-08 Last modified: 2025-07-16 Method: ELECTRON MICROSCOPY (5.92 Å) Cite: A nanobody recognizes a unique conserved epitope and potently neutralizes SARS-CoV-2 omicron variants. Iscience, 26, 2023

本数据集为与纳米抗体（nanobody）W25结合的严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）刺突蛋白（HexaPro突变体）的冷冻电子显微镜（Cryo-Electron Microscopy，简称Cryo-EM）结构（图3，针对受体结合域（Receptor Binding Domain，简称RBD）、W25及相邻N端结构域（N-terminal Domain，简称NTD）开展聚焦精修）。描述项：2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖（2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose）、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖（2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose）、刺突糖蛋白（Spike glycoprotein）等。作者：Lauer S、Spahn C.M.T、Schwefel D。提交日期：2022年10月21日；发布日期：2023年3月8日；最后修改日期：2025年7月16日。实验方法：电子显微镜（分辨率5.92埃）。引用文献：纳米抗体识别独特保守表位并强效中和SARS-CoV-2奥密克戎变异株，《Iscience》，第26卷，2023年。