CCGD-ESCC

This database integrates the results of genome-wide association study (GWAS) of 2,022 ESCC cases and 2,039 controls, survival GWAS of 1,006 ESCC patients, expression quantitative trait loci (eQTL) of 94 ESCC patients, SNVs/indels in the protein-coding regions from 675 whole-genome sequencing or whole-exome sequencing and their associations with ESCC patients' survival.

本数据库整合了多项研究的成果：针对2022例食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma，ESCC）病例与2039例对照人群的全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS）、针对1006例ESCC患者的生存全基因组关联研究（GWAS）、针对94例ESCC患者的表达数量性状位点（expression quantitative trait loci，eQTL）分析结果、来自675例全基因组测序或全外显子组测序样本的蛋白质编码区单核苷酸变异/插入缺失变异（single nucleotide variants/insertions-deletions，SNVs/indels），以及上述变异与ESCC患者生存预后的关联分析结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CCGD-ESCC是一个专注于食管鳞状细胞癌(ESCC)的多组学整合数据库，包含2022例ESCC病例和2039例对照的全基因组关联研究数据、1006例患者的生存分析数据、94例患者的eQTL数据，以及675例全基因组/外显子组测序的编码区变异数据。