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MemBrain v2 Polyribosome Example Usecase

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Zenodo2025-03-19 更新2026-05-26 收录
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https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.15050334
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This dataset corresponds to the example polyribosome chain analysis we show in our MemBrain v2 publication. It contains:- .obj files for mesh surfaces- ..._cluster.star files for per-membrane positions and angles obtained from subtomogram averaging (in STOPGAP, converted to RELION format) of MemBrain-pick predictions- ..._nearest_neighbor.star files containing MemBrain-stats outputs, with nearest neighbor distances and in-plane angles between neighbors- CytoER_14.mrc: Ribosome map obtained from subtomogram averaging

本数据集对应我们在MemBrain v2学术论文中展示的多核糖体链分析示例。 该数据集包含以下内容: - 用于网格表面的.obj文件; - 后缀为_cluster.star的文件:存储对MemBrain-pick预测结果进行子断层平均(subtomogram averaging),采用STOPGAP软件处理并转换为RELION格式后得到的单膜位置与角度信息; - 后缀为_nearest_neighbor.star的文件:包含MemBrain-stats的输出结果,涵盖最近邻距离以及相邻颗粒间的平面内角度; - CytoER_14.mrc:通过子断层平均得到的核糖体图谱。
提供机构:
Zenodo
创建时间:
2025-03-19
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