UbiBrowser

UbiBrowser 2.0 is a comprehensive resource for proteome-wide known and predicted ubiquitin ligase E3/deubiquitinase DUB - substrate interactions in eukaryotic species. These E3/DUB-substrate interactions are derived from five data sources: manual curation, protein GO annotation, protein domain, protein motif and network topology.UbiBrowser 2.0 是一款覆盖真核生物全蛋白质组的已知及预测泛素连接酶E3（ubiquitin ligase E3）/去泛素化酶DUB（deubiquitinase DUB）与底物相互作用的综合资源库。此类E3/DUB-底物相互作用数据来源于五大类数据源：人工手动注释、蛋白质基因本体（Gene Ontology，GO）注释、蛋白质结构域、蛋白质基序以及网络拓扑结构。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

UbiBrowser 3.0是一个综合数据库，旨在描述真核物种中泛素连接酶（E3）、去泛素化酶（DUB）、底物蛋白和泛素链之间的相互作用关系。它包含实验验证和高置信度预测的E3/DUB-底物相互作用对，覆盖39个真核物种，并新增了专注于人类蛋白质泛素链信息的交互浏览功能。