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HOCOMOCO v13 collection of transcription factor binding motifs

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Zenodo2025-02-17 更新2026-05-26 收录
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资源简介:

This dataset contains entire HOCOMOCO v13 collection of DNA binding motifs for human and mouse transcription factors. Data for the previous version HOCOMOCO v12 is also available at Zenodo. See also HOCOMOCO v12 paper. Novel (relative to v12) motifs were obtained as a part of Codebook MEX project. Supplementary files This zenodo record contains motif annotation bundles for hocomoco10, hocomoco11, hocomoco12. They allow one to trace origin of motifs inherited from older versions (v9→v10→v11→v12→v13). Each bundle allows to link a motif to the same motif from the previous collection. Previous motif names are extracted in a separate file `previous_motif_names.json`.

本数据集收录了人类与小鼠转录因子DNA结合基序的完整HOCOMOCO v13集合。 旧版本HOCOMOCO v12的数据同样可在Zenodo平台获取,相关研究可参阅HOCOMOCO v12的发表论文。 相较于v12版本的新增基序,均为Codebook MEX项目的研究成果之一。 补充文件 本Zenodo记录包含针对hocomoco10、hocomoco11、hocomoco12的基序注释包,可用于追溯从旧版本(v9→v10→v11→v12→v13)继承而来的基序来源。每个注释包均可实现将某一基序与前一版本集合中的同名基序进行关联。此前的基序名称已提取至单独的文件`previous_motif_names.json`中。

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2025-02-17
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