DANIO-CODE

We formed the international DANIO-CODE consortium and created a central repository to store and process zebrafish developmental functional genomic data. Our data coordination center ( https://danio-code.zfin.org ) combines a total of 1,802 sets of unpublished and re-analyzed published genomic data, which we used to improve existing annotations and show its utility in experimental design.

我们组建了国际DANIO-CODE联盟，并搭建了中央存储库以存储和处理斑马鱼发育功能基因组数据。我们的数据协调中心（https://danio-code.zfin.org）共计整合了1802套未发表以及经重新分析的已发表基因组数据，依托这批数据我们优化了现有基因组注释，并验证了该资源在实验设计中的应用价值。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

DANIO-CODE是一个斑马鱼测序数据协调中心，专注于收集和标准化注释多种发育阶段（如从早期胚胎到成年）的组学数据，包括RNA-seq、ChIP-seq和甲基化测序等。该数据集提供多种数据访问方式，如下载和基因组浏览器集成，并基于学术研究受欧盟资助支持。