geNomad database
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资源简介:
Marker database used by geNomad for virus and plasmid identification. genomad_db_v1.7.tar.gz: MMseqs2 profile database. Entries are decorated with taxonomy information from a custom taxdump based on ICTV's VMR number 19. genomad_hmm_v1.7.tar.gz: HMMER HMM models. genomad_metadata_v1.7.tsv.gz: Metadata for all the 227,897 markers. genomad_msa_v1.7.tar.gz: Multiple sequence alignments in FASTA format.
本数据库为geNomad用于病毒与质粒识别的标记基因数据库。 genomad_db_v1.7.tar.gz:MMseqs2谱型数据库,其条目搭载了基于国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)第19版病毒元数据库(Virus Metadata Resource, VMR)构建的自定义分类树的分类学注释信息。 genomad_hmm_v1.7.tar.gz:HMMER隐马尔可夫模型(HMM)库。 genomad_metadata_v1.7.tsv.gz:收录全部227,897个标记基因元数据的文件。 genomad_msa_v1.7.tar.gz:FASTA(Fast-All)格式的多序列比对文件。
提供机构:
Zenodo创建时间:
2024-01-30



