Dppc_Berger_Opls06_Nacl_1Mol

MD simulation trajectory and related files for fully hydrated DPPC bilayer with 1 M NaCl. The OPLSAA-compatible Berger-DPPC-06 force field (DOI:10.1088/0953--8984/18/28/S07) was used with Gromacs 5.0.4. Ions were described by the Åqvist parameters. Conditions: T=323K, 72 lipids, 2778 SPC waters, 51 Na, 51 Cl. 120 ns trajectory, last 60 ns analyzed.本数据集包含完全水合的1摩尔/升氯化钠（NaCl）溶液中二棕榈酰磷脂酰胆碱（DPPC, Dipalmitoylphosphatidylcholine）双分子层的分子动力学（MD, Molecular Dynamics）模拟轨迹及相关文件。本次模拟采用与OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场（DOI：10.1088/0953-8984/18/28/S07），并使用Gromacs 5.0.4软件开展模拟。离子体系采用Åqvist参数模型进行描述。模拟参数设置如下：温度为323开尔文，体系包含72个脂质分子、2778个SPC（Simple Point Charge，简单点电荷）水分子、51个钠离子与51个氯离子。模拟总时长为120纳秒，最终选取最后60纳秒的轨迹用于数据分析。