DPPC bilayer after 100 ns
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Equilibrated system of 128 DPPC lipids and 3655 water molecules after 100 ns. <strong>Details:</strong> Berger united atom lipids (needs lipid.itp and dppc.itp from Peter Tieleman's web site at http://moose.bio.ucalgary.ca/). Area per lipid: 0.645 (+/- 0.010) nm<sup>2</sup>. Also available at: http://www.softsimu.net/downloads.shtml <strong>References:</strong> Major artifacts due to truncating electrostatic interactions, Michael Patra, Mikko Karttunen, Marja T. Hyvönen, Emma Falck, Peter Lindqvist, and Ilpo Vattulainen, Biophys. J. 84, 3636-3645 (2003) Lipid bilayers driven to a wrong lane in molecular dynamics simulations by truncation of long-range electrostatic interactions, Michael Patra, Mikko Karttunen, Marja T. Hyvönen, Emma Falck, and Ilpo Vattulainen, J. Phys. Chem. B 108, 4485-4494 (2004).
经100纳秒模拟后达到平衡的体系，包含128个二棕榈酰磷脂酰胆碱（DPPC）脂质与3655个水分子。 <strong>详细信息：</strong>采用Berger联合原子脂质力场（需从Peter Tieleman的官方网站http://moose.bio.ucalgary.ca/获取lipid.itp与dppc.itp拓扑文件）。单位脂质面积为0.645（±0.010）nm²。 该数据集亦可通过http://www.softsimu.net/downloads.shtml获取。 <strong>参考文献：</strong> 1. 《截断静电相互作用引发的主要伪影》（Major artifacts due to truncating electrostatic interactions），Michael Patra、Mikko Karttunen、Marja T. Hyvönen、Emma Falck、Peter Lindqvist、Ilpo Vattulainen，《Biophys. J.》84，3636-3645（2003） 2. 《分子动力学模拟中长程静电相互作用截断导致脂质双层误入歧途》（Lipid bilayers driven to a wrong lane in molecular dynamics simulations by truncation of long-range electrostatic interactions），Michael Patra、Mikko Karttunen、Marja T. Hyvönen、Emma Falck、Ilpo Vattulainen，《J. Phys. Chem. B》108，4485-4494（2004）
