Supplementary data of the Master's thesis: "Comparative genomics of Bifidobacterium longum using 1,566 publicly available isolate and metagenome-assembled genomes"

Supplementary data tables and a supplementary data guide of the Master's thesis: "Comparative genomics of Bifidobacterium longum using 1,566 publicly available isolate and metagenome-assembled genomes". Description of the supplementary data. Abbreviations: HGBL = Human Gut Bifidobacterium longum genome catalogue, CAZyme = carbohydrate-active enzyme, ARG = antibiotic resistance gene. Table name Table content Table S1 Metadata of all collected genomes Table S2 HGBL metadata Table S3 Quality comparison results Table S4 Summary of dbCAN3 annotation results Table S5 Summary of RGI annotation results Table S6 CAZyme category count enrichment results Table S7 ARG count enrichment results Table S8 Enrichment results of individual CAZymes Table S9 Enrichment results of individual ARGs本硕士学位论文《基于1566个公开获取的分离株与宏基因组组装基因组的长双歧杆菌比较基因组学研究》的补充数据表及补充数据指南。 补充数据说明。 缩写说明：HGBL = 人肠道长双歧杆菌基因组目录（Human Gut Bifidobacterium longum genome catalogue），CAZyme = 碳水化合物活性酶（carbohydrate-active enzyme），ARG = 抗生素抗性基因（antibiotic resistance gene）。 表格名称 表格内容 表S1 所有收集基因组的元数据 表S2 HGBL元数据 表S3 质量比对结果 表S4 dbCAN3注释结果汇总 表S5 RGI注释结果汇总 表S6 碳水化合物活性酶类别计数富集分析结果 表S7 抗生素抗性基因计数富集分析结果 表S8 单种碳水化合物活性酶富集分析结果 表S9 单种抗生素抗性基因富集分析结果