Input files for "Thermodynamics of PAM recognition by Cas9 of Streptococcus pyogenes"

Details for compressed directory "Input Files" The directory, "Input files" contains sub-directories "Alchemical simulations" and "Conventional MD". Both directories contain input topologies (hybrid topologies for alchemical simulations inside directory "Alchemical simulations"), MDP files for running different stages of MD and alchemical simulations, coordinate files and other input files required for conventional/alchemical simulations.压缩目录「输入文件（Input Files）」详情 本目录「输入文件（Input Files）」包含两个子目录，分别为「变分模拟（Alchemical simulations）」与「常规分子动力学（Conventional MD）」。 两个子目录均包含输入拓扑文件（其中「变分模拟」目录内的拓扑文件为专供变分模拟使用的混合拓扑文件）、用于运行分子动力学（MD）及变分模拟各阶段的MDP文件、坐标文件，以及常规/变分模拟所需的其他输入文件。