遇见数据集

brightfieldBigPatchSwarmingImaging_npr-1_rep5_part3

收藏
Zenodo2020-09-20 更新2026-05-25 收录
数据链接:
官方服务:

资源简介:

This experiment is part of the Bright field big patch swarming imaging dataset for the following publication: https://www.biorxiv.org/content/early/2018/11/01/398370 <strong>strain</strong> : DA609 <strong>timestamp</strong> : 20180608 <strong>strain_description</strong> : DA609: npr-1(ad609)X. <strong>sex</strong> : hermaphrodite <strong>stage</strong> : adult <strong>media</strong> : NGM agar low peptone <strong>arena</strong> : <strong>style</strong> : petri <strong>size</strong> : 35 <strong>food</strong> : OP50, diluted OD = 0.38, inoculated overnight at room temperature <strong>who</strong> : S. Serena Ding <strong>protocol</strong> : Method in Ding, Schumacher et al. doi.org/10.1101/398370. Alternatively, visit dx.doi.org/10.17504/protocols.io.vyhe7t6. <strong>lab</strong> : <strong>name</strong> : Behavioural Genomics <strong>location</strong> : London, United Kingdom <strong>software</strong> : <strong>name</strong> : tierpsy (https://github.com/ver228/tierpsy-tracker) <strong>days_of_adulthood</strong> : 1 <strong>total time (s)</strong> : 3600 per file <strong>frames per second</strong> : 25 <strong>video micrometers per pixel</strong> : 10

本实验隶属于用于下述预印本论文的明场(bright field)大视野集群成像数据集,论文链接:https://www.biorxiv.org/content/early/2018/11/01/398370 - 菌株(strain):DA609 - 时间戳(timestamp):20180608 - 菌株描述(strain_description):DA609: npr-1(ad609)X - 性别(sex):雌雄同体 - 发育阶段(stage):成虫期 - 培养基(media):低蛋白胨NGM琼脂培养基 - 实验载体(arena): - 类型(style):培养皿型 - 规格(size):35 - 食物(food):OP50菌株,稀释光密度(OD)=0.38,于室温下接种过夜 - 实验执行者(who):S. Serena Ding - 实验方案(protocol):详见Ding、Schumacher等人的研究方法(doi.org/10.1101/398370);亦可访问dx.doi.org/10.17504/protocols.io.vyhe7t6获取完整实验方案 - 所属实验室(lab): - 名称(name):行为基因组学(Behavioural Genomics)实验室 - 地点(location):英国伦敦 - 分析软件(software): - 名称(name):tierpsy(https://github.com/ver228/tierpsy-tracker) - 成虫后天数(days_of_adulthood):1 - 单文件总时长(total time (s)):3600秒/文件 - 帧率(frames per second):25帧/秒 - 像素微米换算系数(video micrometers per pixel):10微米/像素

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2018-11-29
二维码
社区交流群
二维码
科研交流群
商业服务