Systems level profiling of chemotherapy-induced stress resolution reveals druggable trade-offs

Directory structure: --[ROOT] ----[Kallisto] 50x bootstraped Kallisto-derived estimated counts ----[Library] transcript-to-gene mapping for tximport ----[Metabolomics] normalised metabolyte levels from service provider (Metabolon Inc.) ----[Proteomics] normalised protein levels from service provider (Francis Crick Institute) ----RNAseq.R, produce RNA-seq counts and abundances from Kallisto data ----Metabolomics.R, input + transform + QC metabolomics data ----Proteomics.R, input + QC proteomics da目录结构： --[根目录] ----[Kallisto]：经50次自举得到的Kallisto衍生估计计数 ----[Library]：用于tximport分析的转录本-基因映射文件 ----[Metabolomics]：服务提供商Metabolon公司提供的标准化代谢物水平数据 ----[Proteomics]：服务提供商弗朗西斯·克里克研究所提供的标准化蛋白质水平数据 ----RNAseq.R：用于从Kallisto数据生成RNA测序计数与丰度值的脚本 ----Metabolomics.R：用于代谢组学数据的导入、转换与质量控制的脚本 ----Proteomics.R：用于蛋白质组学数据导入与质量控制的脚本（原描述末尾“da”为“data”的笔误）