CIRCpedia

CIRCpedia v3 is a comprehensively upgraded circular RNA research platform integrating 2,350 NGS and 63 TGS datasets spanning 20 species. It systematically annotates 2.6 million circular RNAs with conservation insights, cognate linear RNA expression profiles, and degradation dynamics. The update introduces four innovative modules: gene editing validation, therapeutic circRNA optimization, subcellular localization prediction, and multi-molecular interaction analysis. An enhanced interactive visualization suite enables dynamic data filtering, cross-dataset comparison, and real-time analytics.CIRCpedia v3是一款全面升级的环状RNA（circular RNA）研究平台，整合了覆盖20个物种类别的2350个下一代测序（Next-Generation Sequencing，NGS）与63个三代测序（Third-Generation Sequencing，TGS）数据集。该平台对260万条环状RNA完成系统性注释，涵盖进化保守性特征、同源线性RNA表达谱以及降解动力学特征。本次更新新增四大创新模块：基因编辑验证、治疗性环状RNA优化、亚细胞定位预测以及多分子相互作用分析。升级后的交互式可视化套件支持动态数据筛选、跨数据集比对与实时数据分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CIRCpedia v3是一个全面升级的环状RNA研究平台，整合了涵盖20个物种的2350个NGS和63个TGS数据集，系统注释了260万个环状RNA。该平台新增了基因编辑验证、治疗性circRNA优化等四个创新模块，并提供增强的交互式可视化功能，支持动态数据过滤和跨数据集比较。